Karaalioğlu'nun babası Ali Karaalioğlu için Marmara İlahiyat Fakültesi Camii'nde cenaze töreni düzenlendi. Törene, Cumhurbaşkanı Tayyip Erdoğan, 11. Cumhurbaşkanı Abdullah Gül, İstanbul Valisi Vasip Şahin, İstanbul Emniyet Müdürü Mustafa Çalışkan, İstanbul Büyükşehir Belediye Başkanı Kadir Topbaş, AK Parti İl Başkanı Selim Temurci, Üsküdar Belediye Başkanı Hilmi Türkmen, yakınları ve sevenleri katıldı.
Cumhurbaşkanı Erdoğan ve 11. Cumhurbaşkanı Gül, Mustafa Karaalioğlu'na başsağlığı dileğinde bulunduktan sonra Mustafa Karaalioğlu'nun oğlu Ahmet Karaalioğlu ile ilgilendiler. Memleketi Trabzon'da 'Hacı Hafız' adıyla tanınan Ali Karaalioğlu'nun cenaze namazında Erdoğan ve Gül yan yana saf tuttu. Cenaze namazı kılınıp helallik alındıktan sonra Erdoğan ve Gül tabutu birlikte omuzladı. Cenaze aracının yanına kadar yürüyen Erdoğan ve Gül cenazeyi yolcu ettikten sonra bir süre vatandaşlarla sohbet etti. Ali Karaalioğlu'nun cenazesi Çengelköy mezarlığında toprağa verildi.