Her takım birbiriyle iç ve dış saha olmak üzere iki kez karşılaşacak. Grup lideri ve ikincisi, UEFA Şampiyonlar Ligi'nden gelecek 8 grup üçüncüsüyle birlikte son 32 takım arasına kalacak. Gruplarda maçlar 15 Eylül, 29 Eylül, 20 Ekim, 3 Kasım, 24 Kasım ve 8 Aralık'ta oynanacak.UEFA Avrupa Ligi'nde bu sezon final İsveç'in Solna kentindeki Friends Arena'da 24 Mayıs 2017'de oynanacak. Kazanan takım UEFA Şampiyonlar Ligi'ne doğrudan katılma hakkı kazanacak.İŞTE GRUPLAR:A GRUBU: Manchester United, Fenerbahçe, Feyenoord, Zorya LuhanskB GRUBU: Olympiakos, APOEL, Young Boys, AstanaC GRUBU: Anderlecht, St. Etienne, Mainz, QabalaD GRUBU: Zenit, AZ Alkmaar, Maccabi Tel Aviv, Dundalk E GRUBU: Viktoria Plzen, Roma, Avusturya Wien, AstraF GRUBU: Athletic Bilbao, Genk, Rapid Wien, SassuoloG GRUBU: Ajax, Standart Liege, Celta Vigo, PanathianikosH GRUBU: Shakhtar Donetsk, Braga, Gent, Atiker KonyasporI GRUBU: Schalke 04, Salzburg, Krasnodar, NiceJ GRUBU: Fiorentina, PAOK, Slovan Liberec, KarabağK GRUBU: Inter, Sparta Prag, Southampton, H. Beer-ShevaL GRUBU: Villarreal, Steaua Bükreş, Zürih, Osmanlıspor