KORAY TAŞDEMİR/İSTANBUL
İddianamede şu ifadelere yer verildi: "Örgütün genel yapılanması, Kainat İmamı, Kıta (Coğrafi Bölge) İmamları, Ülkeİmamları, Eyalet (Bölge) İmamları, İl İmamları, Küçük İl Bölge İmamları (Sadece Büyük Şehirlerde), İlçe İmamları, Semt İmamları, Mahalle İmamları, Ev İmamları olmak üzere hiyerarşik bir şekilde sıralanmaktadır.Örgütün yapılanması ile ilgili eldeki bilgi ve belgelere göre; "yurt içi ve yurt dışıyapılanması" olarak ikiye ayrılmaktadır. Ülke içindeki yapılanma da Devlet daireleri yapılanması ve diğer yapılanma olarak iki türlüdür."
Paralel ve hayalet yapılar
İddianamede FETÖ'nün devlet içinde hem paralel hem de hayalet yapı olarak iki şekilde örgütlendiği ifade edildi: "Devlete Paralel Hiyerarşik Yapılanma: Devlet içinde Devlet gibi ayrı bir yapılanmayaizin verilemez. Devletin hiyerarşisi dışında ayrıca bir Örgüt hiyerarşisinin varlığı kabuledilemez. Ancak FETÖ'nün, her Devlet kurumu ve kamu idaresinin içindeki resmiyöneticilerine paralel olarak Örgüt tarafından tayin edilmiş imam yöneticileri vardır. Bu örgütün önemli bir yapılanmasını "Devair-i Devlet" yapılanması olarak ifade edilen Devlet daireleri yapılanması oluşturmaktadır. Bizzat Fetullah Gülen'in talimatı ile yurt içi ve yurt dışında kurulmuştur.Örgüt yapılanması içinde faaliyet gösteren şahısların bilmediği ve sadece FetullahGülen'in bildiği ve atamasını yaptığı, hayalet bir yapı bulunmaktadır. Hayalet yapının görevi Örgüt içerisinde oto kontrol sistemi ile yapıyı denetlemek ve bizzat Fetullah Gülen'e rapor vermek, aynı zamanda da mutlak itaat ile yukarıdan gelecek olan emir ve talimatları hiçsorgulamadan, eksiksiz ve tam olarak yerine getirmektir."